一九九九年至二零零三年任云南大学公共管理学院党委副书记；二零零三年后任马列部党总支书记，二零零四年开始主持马列部全面工作，二零零五年十二月改任马列部主任，同年底云大党委决定在马列部基础上组建马克思主义研究院，始任院长、教授，所谓“专家组”成员。

一九九九年“七二零”迫害法轮功开始，苏升乾作为中共御用文人，积极参与迫害法轮功，二零零一年以后成为云南省转化“专家组成员”，还兼有云南省演讲学会副会长之职。多次到劳教所及全省各地洗脑班散布诽谤法轮大法的言论，对法轮功学员进行强迫洗脑，逼迫放弃信仰。

苏升乾跟随蔡朝东、“610”主要成员彭国军、杨兴源等人组成的所谓“巡回演讲团”，在云南十一个地、州、市、县共演讲了六十二场，对六万三千人进行洗脑毒害。

苏升乾曾经在《云南日报》刊载诬陷法轮功文章：《破解邪教》、《有神论对人生观的侵害及纠正》、《崇尚科学抵制邪教》等文章，在云南电视台担任特邀主持人，主持《周末夜话》栏目一百一十场左右。苏升乾被评为二零零一年云南省反×教斗争先进个人。