二零二一年三月二十七日，肖玉霞被劫持到云南省第二女子监狱，先被关到八监区隔离十五天。隔离监区队长冉涛要求肖玉霞说报告词、写认罪书等，肖玉霞坚决抵制这种邪恶要求。

隔离十五天后，肖玉霞就被转到九监区的专管分监区三组，责任狱警刘婷，派犯人罗双萍、王萍包夹肖玉霞，两犯人处处刁难肖玉霞。按照所谓监狱规定，新入监被严管至少要两个月，但是肖玉霞才一个月就遭一级严管。严管分三级，完全由狱警和包夹犯人说了算，一级严管每天只能上四次厕所，早上六点多钟去上一次厕所之后就要到上午十点多才能上厕所。八点半要到楼下场地去操练队列，肖玉霞要求在去操练队列前再去上一次厕所，遭到无理拒绝后，肖玉霞拒绝到楼下去操练队列，两个包夹对她破口大骂，狱警后同意肖玉霞去上厕所再下去操练队列。之后的一个月每天就可以多上几次厕所，但是一个月后，犯人陈娜萍当监督岗就又开始安排上厕所，一天又只能上四次厕所了。

法轮功学员遭严管迫害后，每天早上五点四十分起床，在监房洗漱，等监督岗犯人安排才能如厕（九监区为了不让法轮功学员互相见面，连如厕、洗漱都要一个一个安排），然后就被强迫坐小板凳，一直坐到晚上十点钟。每天只能上四次厕所，除早晚两次之外，每天上午十点半、下午四点各安排上一次厕所。中午、下午吃完饭洗碗，洗完碗回来经过厕所都不给上厕所，被强迫回来接着坐小凳。

因为严管期间限制如厕，每天只给四杯水喝，造成肖玉霞经常便秘，十分痛苦。每晚还要轮流值班，每个班一个半小时，值班的时候也要求坐着。每周洗一次澡，每周洗澡时间只有五分钟，还要连带洗内衣、袜子，很多时候刚刚把肥皂涂在身上，监督岗犯人就说时间到了，把水关了。每周只有洗澡可以到洗漱间去洗，平时只能在监房的盆里洗，刷牙的沫子也只能吐在里面。被严管期间，半个月洗一次衣服，洗衣服的这次连带洗澡一共二十分钟，因为赶时间，忙着都要摔倒。两个月洗一次被子，但洗被子还要写申请，申请里要自称罪犯以及被强加的罪名，狱警才会批准洗被子。

遭严管迫害的法轮功学员每月限制消费一百元，只能买必须生活用品，但是实际上完全由狱警来决定可以购买的物品和消费金额。肖玉霞到监狱的第一个月什么都没有，申请购买生活必需品九十多元，但是被主管狱警刘婷随意删减，特别是克扣卫生纸，最后只买了三十七元的生活必需品。遭严管迫害的法轮功学员不能打电话，不能见家人。但狱方为了“转化”法轮功学员，会不定时安排家属来监狱，以达到“转化”的目的。

肖玉霞还被强迫出监劳动，在一根十米长的条条上缝珠串，完不成定额就要罚中午抬饭，罚一个星期打扫厕所。

二零二三年四月份，在肖玉霞出狱前半年，狱警又对她进行攻坚“转化”迫害，逼她每天长时间坐小凳，每天逼看谎言视频六、七个小时，一直放到没有电为止。责任警刘婷还打电话给肖玉霞家属，叫拍一些孙子、孙女的视频拿到监狱给肖玉霞看，想用亲情威胁肖玉霞“转化”。看肖玉霞不“转化”，又不给她视频接见了。