一九九九年七月恶党开始迫害法轮功之后，赵玉琴于十月进京上访说明真相，先后五次被恶党人员非法抓捕、拘留、送洗脑班迫害。二零零一年十二月份，赵玉琴被绑架到派出所，送沈阳四台子非法拘留十五天。

二零零二年八月，赵玉琴被派出所街道不法人员绑架到北大营洗脑班迫害，后正念走脱，被迫流离失所。二零零三年七月派出所伙同街道不法人员又到家抓捕，她从自家2楼跳出，走脱后又流离失所半年之久。

二零零三年十二月街道让她去社区盖章，她同丈夫去后，被早已安排好的610人员绑架。大东区“610”办公室主任尹××一手策划，指挥大东区上园派出所、大东区二台子街道办，在众目睽睽之下，将赵玉琴非法劫持，暴徒们硬是摁着她的头将其塞进车内，送沈阳张士教养院洗脑班迫害。

由于长期受到恶党不法人员的骚扰和跟踪迫害，赵玉琴身心受到极大的伤害，在恶党长期迫害中，于二零零六年二月二十四日含冤离世。