2005年至2009年底担任梅县法院院长，在其担任梅县法院院长职期间，梅县多名法轮功学员如2008年朱贤生等人被非法判刑。2009年12月开始担任起任蕉岭县法院代院长、院长。由于2014年1月以来，蕉岭县法院先后有8名警察因涉嫌滥用职权、收受贿赂等行为被检察机关立案侦查，其中包括法院领导班子成员1人，正、副庭长7人。陈小清作为该院党组书记、院长，对上述问题的发生应当承担教育监管及查处不力的领导责任。2014年底左右，陈小清被免去院长职务。