二零零零年十一月至二零零一年一月，孙远良任辽宁省辽阳市委副书记、副市长、代市长；二零零一年一月至二零零四年八月，任辽宁省辽阳市委副书记、市长；二零零四年八月至二零一零年十月，任辽宁省辽阳市委书记。

孙远良从二零零零年末至二零一零年十年间，分别担任了辽阳市正、副市长，辽阳市委正、副书记等职位。孙远良、郝春荣、马立阳三人在辽阳市任职期间一起共事多年。在这个期间，是辽阳市法轮功学员遭迫害的高峰期。街道社区、“610”人员不断的骚扰法轮功学员及其家属，辽阳市各区、县定期设立了洗脑班，将成百上千的法轮功学员绑架到洗脑班强迫放弃修炼，用扣除工资、子女的升学、当兵等威逼，卡住人的生存权，让人无路可走，有的法轮功学员不愿放弃信仰被送到劳教所或被非法判刑，高强度奴工、酷刑折磨，有的甚至被迫害致死。