据明慧网综合报导，从一九九九年到二零零六年五月份，中共中央军委开过六次“处理涉外宗教问题”专门性会议，主要就是针对法轮功。

此后，以中共军队后勤部为首的军队系统层层开动，开动中共建政以来形成的活摘器官系统，开始按照迫害元凶江泽民的意愿活摘法轮功学员器官，达到其“肉体上消灭”的迫害目的，而贩卖器官成了一条被江泽民默许而鼓励的军队生财之路。

有报道称，中共盗取法轮功学员器官大规模活摘从二零零三年至二零零六年进入高峰期。据悉，中共军队通过独立的后勤系统、武装保卫、交通运输、情报保密、医疗设施主导活摘法轮功学员器官和移植产业，控制了中国98％的器官移植源。

解放军总参谋部直接参加迫害法轮功，作为军队的指挥系统，在迫害法轮功中同样起着极坏的作用，把其拥有的情报、间谍和军事技术用于迫害法轮功，包括收集所谓的“法轮功情报”，监听国际通讯，组织针对法轮功创始人李洪志先生的暗杀活动。解放军总后勤部是活摘器官的核心管理机构。此外，军队走私活人贩卖活体器官。

二零零八年六月二十八日下午，南京军区白下区第一军区二干休所退休军干罗祖华老人向路人讲述法轮功真相，被贵阳中中派出所恶警抓捕，并通知花溪军区干休所将罗祖华押回家中，监视居住。贵州军区花溪所所长宋明亮、雷敏用一把特大号的锁将罗祖华锁在家中。罗祖华再次出走。据闻，此事惹怒贵州军区，乃至中央军委，内传中央军委副主席徐才厚下令非抓住罗祖华不可，生要见人，死要见尸。他们遂用最先进的装备在贵阳的大街小巷，以及她亲戚家反覆搜寻两个月有余。

徐才厚是军中最大的贪官之一，也是江泽民在军队中最为相信之人，与周永康、谷俊山、薄熙来等有着割舍不清的利益交往。除了处处吹捧江泽民，徐才厚还追随其脚步，不折不扣地执行着江对法轮功的迫害政策，迫害军队中的法轮功学员。

由于军队的特殊性和保密性，其迫害法轮功的情况隐藏的比地方更不容易被外界所知，但还是有一些被揭露出来。

徐才厚主掌中共军队期间，各地军队医院大量参与活体器官移植的罪恶备受国际瞩目。

二零一四年三月十五日，数十名武警从北京301医院将病床上的徐才厚带走。同时带走的，还有他的妻子、女儿和秘书。71岁的徐才厚收获了自己种下的恶果。

二零一四年六月三十日，中共前中共军委副主席徐才厚被移送军事检察院处理。通报中声称，经审查，徐才厚利用职务便利，为他人晋升职务提供帮助，直接和通过家人收受贿赂；利用职务影响为他人谋利，其家人收受他人财物，涉嫌受贿犯罪，情节严重，影响恶劣。