在担任村支书期间，先后多次派人监视本村大法弟子。二零零二年七月，受渭滨区石鼓镇指示，将本村五名法轮功学员非法关押在镇上近一周，并非法每人收了二百元。

法轮功学员曾劝他不要听信邪党的谎言参与迫害，但马根明一概不听，恣意妄为。

二零零七年七月，马根明到医院检查出胃癌，于二零零八年元月短短半年时间，就遭恶报去世。