石昌伦在任主任期间，主要负责所谓的「防邪教」工作（实际上共产党本身是世界上最大的邪教），配合其上级「六一零办」（凌驾于宪法与法律之上专门迫害法轮功的机构）对法轮功学员进行迫害，期间曾发生过法轮功学员在木耳镇讲真相被非法抓捕的事（详见《重庆市渝北区木耳镇派出所绑架三名法轮功学员》）。