从九九年江泽民迫害法轮功开始，杨本玉主管签字非法对法轮功学员的关押、劳教、判刑等，期间疑似得脑瘤等疾病，法轮功学员善意劝他不要干这个活，可是他不听相劝，在身体不允许的情况下，仍然参与迫害，多名法轮功学员被非法劳教、判刑等。后来，杨本玉身体出现怪病：人站着血压就高，躺着血压就低，坐着全身疼痛难耐，最终于二零一七年末、二零一八年初在痛苦中悲惨死去，年五十几岁。