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一九九九年七月中共恶首江泽民下令迫害法轮功之后，时任中共教育部部长的陈至立步步紧跟，成为在教育系统实施江氏灭绝法轮功政策的积极推行者和具体实施者，迫害面覆盖之广（研究生院、大、中、小学包括幼儿园），受害者人数之巨，程度之深，手段之恶劣，中外教育史罕见。
陈至立任教育部长期间，中国各地教育系统内的许多学生、教师由于信仰法轮功被“揭批”，或在教育系统内遭到各种歧视、同时被要求停止修炼法轮功，否则他们将被举报给安全部门。被举报给610办公室或其它安全部门的人士则遭酷刑折磨、非法关押、性侵犯。
据追查国际报告，陈至立利用与江泽民的特殊关系和获得的特权，在中国教育系统推行江氏的迫害政策。陈至立多次召开各种会议亲自部署对法轮功的迫害，以教育部名义发文，在全国所有大、中、小学的教师和学生中，大搞“文革”式的人人表态过关；强迫教师学生观看诽谤、攻击法轮功的电影；在大、中、小学强制推行反法轮功的“百万签名”运动，胁迫学生签参与这场由少数人发动的迫害；通过教育系统将攻击和诬蔑法轮功的内容编进中小学教材及各级考题，甚至高考和研究生的试题中；将中央电视台等媒体陷害法轮功的节目作为师范院校学习内容，在未来的教师队伍中进行煽动仇恨的灌输，以达到长期精神控制的目的。
陈至立利用国家教育资源对几亿青少年灌输谎言和仇恨宣传，通过煽动不明真相的青年学生参与反法轮功的群众运动，达到其消除法轮功信仰的目的。例如，“天安门自焚”骗局后，二零零一年二月一日，由陈至立为首的国家教育部党组、共青团中央联合下发的通知（教党[2001]1号），要求各省、自治区、直辖市党委教育工作部门、教育厅（教委）、共青团委员会，教育部直属高校广泛开展反对法轮功的活动。接着，全国大规模学生群众运动就开始了。
二零零一年二月六日一天的时间里，在中央“610办公室”主任王茂林、团中央书记处第一书记周强、团中央书记处书记赵勇等直接指挥下，全国100个大中城市的近千个社区的800万青少年，直接被利用参与反对法轮功的宣传活动，当天共张贴宣传画50多万幅，发放宣传资料1000多万份，举行集会200多场。二零零一年二月，全国100个大中城市的1500多个青年社区，在不明真相且被胁迫利用的青少年学生的带动下，发动了1200多万社区居民签名保证“不信、不传、抵制”，通过利用青少年，将所谓反法轮功声势推向社会。
二零零二年七月三日至四日，陈至立出席教育部组织召开了全国教育外事工作会议并讲话，讲话中透露驻外使、领馆教育处（组）在打压法轮功方面做了大量的工作。在江泽民、陈至立的授意下，各国使领馆在海外的华人社区中，大面积推广迫害。
据不完全统计，仅二零零三年至少有210所中国大专院校的435名法轮功学员被强迫送各类“转化班”、劳教所和精神病院。教育系统官员以剥夺教师工作权利，剥夺学生升学权利为要挟，实施系统的迫害。自一九九九年，仅清华大学就有300多名教授、教师、博士、硕士、大学生被非法关押，开除工职，学业，或直接送入劳教所。
陈至立以出国“文化、教育交流、考察”名义，无偿巨资资助其它国家，实施渗透，目的是把对法轮功的攻击和迫害推向国际社会。在几千万中国儿童因贫困失学的前提下，陈却利用手中的权力在国外大肆挥霍教育资金和国家的财力。
原中共教育部长陈至立在二零零四年访问坦桑尼亚期间，被法轮功学员控告到坦桑尼亚法院，从而被坦桑尼亚法庭传讯并到庭接受调查。
前进劳教所暴力“转化” 多名法轮功学员遭酷刑
http://www.minghui.org/mh/articles/2011/12/14/前进劳教所暴力“转化”-多名法轮功学员遭酷刑-250567.html
请关注你身边遭受迫害的法轮功学员
http://www.minghui.org/mh/articles/2008/12/4/191044.html
山东青年艺术家因坚持信仰被迫害的无家可归（图）
http://minghui.org/mh/articles/2007/5/6/154195.html
华南理工大学恶党人员对法轮功学员的迫害
http://www.minghui.org/mh/articles/2007/2/8/148525.html
因信仰遭虐杀和判刑的中国高校师生（图）致
http://www.minghui.ca/mh/articles/2004/8/7/81235.html