一九九九年五月六日，宜昌市委书记兼市长孙志刚，召开全市（宜昌地区）维护稳定工作电视电话会议，传达在“4.25”维护稳定中央重要指示及省委电视电话会议维稳精神，部署迫害法轮功。随后，市委建立由孙志刚任领导小组组长，成立全市（整个宜昌地区）各个部门迫害法轮功领导小组285个，针对法轮功专班工作人员达1560人，负责领导和指挥与法轮功的政治斗争。

一九九九年七月十九～二十日，法轮功辅导员、站长被抓，一九九九年七月二十日当天大法弟子到市委请愿，反映情况，孙志刚拒绝倾听炼功群众心声，粗暴的动用武警、警察，把大法弟子用客车拖走，拉回原籍住处。

一九九九年七月二十二日，市委书记兼市长孙志刚主持召开宜昌市处理法轮功问题领导小组第一次全体会议，收看央视污蔑造谣法轮功的新闻，讨论研究迫害宜昌法轮功的问题。宜昌市委在南湖宾馆和西陵剧场分别召开副市级领导干部会议和市直副处以上党员干部会议，传达中央13号文件精神以及中央省委领导的重要讲话，推动迫害宜昌地区法轮功学员。

一九九九年十二月二十六日市委书记孙志刚在第二次代表大会报告上宣布：要继续深入开展对法轮功的斗争。

二零零零年至二零零一年，针对法轮功学员，不断进京上访，重新发表声明坚持继续修炼。孙志刚亲自领导指挥，“处理法轮功问题”的会议达十多次，迫害本市法轮功学员。二零零零年六月，孙志刚为宜昌市科协“崇尚科学，反对迷信”科普展亲自题词。前后有三万人参观。后续又在社区，街道办展览，污蔑法轮功，前后大概六万人受毒害。

二零零一年四月十九日，视察鼓楼街派出所，督战迫害赵询等做真相资料的法轮功学员。孙志刚追随江泽民流氓集团，积极参与迫害，十分仇视法轮功。二零零二年八～二零零六年九月，担任湖北省委常委、秘书长，省直机关工委书记。