一九九九年七月二十日以来李佑才迫害法轮功主要责任人，是迫害宜昌大法弟子的推手之一，十分仇视法轮功。

二零零一年李佑才亲自批示，成立调查法轮功散发真相资料专案组。参与迫害十几名大法弟子，非法重判赵询等几人五～八年刑期，是迫害法轮功主谋之一。

李佑才任职期间迫害法轮功学员实例

二零零六年三月份，宜都市大法弟子赵举才在家中被宜都市六一零、国保和红花套派出所绑架后，被非法关押在宜都市第一看守所。二零零六年八月三十一日，赵举才被宜都市法院、宜昌市中级法院非法判七年。赵举才被迫害致全身浮肿、吃不进饭，一吃就吐，完全丧失自理能力。在看守所内赵举才遭到不法恶警的酷刑逼供，如“背宝剑”，在红花套派出所柳姓恶警曾用文件夹狠打赵举才的脸等。