2000年7月13日，吴荣跃下班回家途中，去同修李杰琳家归还书籍，被正在那儿抄家的南岸区国安刘思明一伙绑架，随后被关押在南坪派出所一夜。第二天被转交给重庆铁路公安处，吴荣跃被投入铁路第一看守所。在这里被非法关押一个月后，吴荣跃被非法劳教两年。

吴荣跃在四川资阳大堰劳教所受到了更为非人道的摧残。2001年初，吴荣跃被调到人称“魔鬼中队”的四中队，队长是廖良，以超强奴工进行迫害。这中队是烧砖的，吴荣跃被分去拉石头，每天推着五、六百斤的页岩石头在坑洼不平的泥路上来回奔跑，供应原料，而且是自己装卸。尽管吴荣跃每天上气不接下气，汗水从未干过，全身肌肉都在痛，仍然完不成他们规定的数量，就被罚做苦工，收工后还要做很多鞭炮才能睡觉。天不亮又上工地了，身体和心理的压力都到了极限。但是吴荣跃仍然坚定正信，不再屈服。时间久了，他们才作罢。