二零二零年十一月至二零二零年十二月，任中共甘肃省委党组成员；二零二零年十二月至二零二二年五月任甘肃省委党组成员、副省长；二零二二年五月至二零二二年六月，任甘肃省委常委，副省长；二零二二年六月至今任甘肃省委常委、政法委书记。

据不完全统计，自刘长根任中共甘肃省委常委、省政法委书记短短的一年多时间里，至少有法轮功学员李凤兰、卢云飞、高吉银、苏安洲等被迫害致死，众多的法轮功学员遭到绑架、关押，三十多人被非法判刑等迫害。刘长根应对任期期间甘肃省发生的对法轮功学员的严重迫害负有不可推卸的直接责任。

刘长根自二零二二年六月任中共甘肃省政法委书记以来，操纵、指挥各级政法委、610办公室、公安局等部门极力迫害法轮功，二零二二年九月发表署名文章要求全省持续深化反邪教斗争。（注：中共是真正的邪教）

二零二三年六月十六日，刘长根在甘肃农业大学，启动甘肃省高校反邪教联盟仪式上并讲话，称自二零二二年以来，甘肃省政法委、省教育厅、省科协积极推动在全省高校成立反邪教协会，截至二零二三年五月，已有26所高校成立反邪教协会。

二零二三年九月十八日，由中国反邪教协会、甘肃省委政法委、甘肃省科学技术协会共同主办的二零二三年中国西部省份反邪教工作研讨会在张掖召开。省委常委、省委政法委书记刘长根出席会议并讲话。要求“一手抓邪教人员教育转化，一手抓邪教组织违法犯罪打击整治。”同时，加强与周边省份协作配合，积极开展反邪教宣传教育、理论问题研究和基层基础建设，成立高校反邪教协会、企业反邪教协会，组建高校反邪教联盟，

二零二三年九月，由甘肃省委政法委、省高级法院、省检察院、省公安厅、省司法厅、省国家安全厅、省科学技术协会共同主办的二零二三年甘肃省反邪教集中宣传活动启动仪式上，刘长根提出“打造网上反邪教全媒体宣传平台”，“坚决打好打赢反邪教斗争 ”。

为了强制法轮功学员放弃信仰真、善、忍的目的，刘长根指挥各地政法委、六一零、政法部门、街道办、社区、村镇人员对法轮功学员长期跟踪、骚扰、绑架、关押、拘留、冤判等，不断制造人权灾难。刘长根还亲自安排省政法委人员对非法关押在甘肃监狱的法轮功学员的所谓“转化验收”，验收时必须正面回答三个问题：法轮功是不是某教？法轮功师父是人还是神？是否还继续修炼法轮功？企图达到对法轮功学员彻底放弃信仰的罪恶目的。