2001年春，他指使市二院院长张勇，伙同其共同行恶，将单位里大法学员刘萍从单位绑架至洗脑班进行迫害。2001年10月9日，张勇指令王新婷安排大法弟子刘苹下午一个人值班，在接近下班时间将刘苹绑架到洗脑班。当时的卫生局长王建军一脸淫笑的对刘苹说：「刘苹，你还年轻，你别练了，刘苹保证你大有前途。」刘苹说，「你看起来像个流氓，你不配跟刘苹说话。」他坐了一会儿觉得没意思就走了。

2001年冬，王建军命令桃城区医药公司将其单位大法弟子王云香绑架至洗脑班进行迫害，她为抵制迫害，被迫流离失所，他动用全公司的职工查找她，不让睡觉，并亲自带人去她的亲戚家骚扰，她被迫流离失所8个月，家中只剩下幼小的孩子和有病的丈夫。