他主持操办在法华路校区改造宿舍楼的其中一层，窗户和楼出口门焊上铁架，变成私设的非法监禁区，在这里非法关押炼功师生进行洗脑迫害。被在这里非法监禁洗脑的弟子有：梅建琦，季立律，庄玮，白建军，郭小军，黎涛，万锋，吴宇新，赵洪涛等。

李新坤勾结上海公安局文保分局，大肆对学校坚持不放弃“真、善、忍”正信，出来讲真相和上访的炼功师生进行牢狱迫害。其中电子信息学院教师郭小军和动力机械学院四年级学生梅建琦各被非法判刑五年；博士生杨亦宁，博士生白建军，硕士生庄玮（女），博士生向东辉，博士生吴宇新，硕士生黎涛等都被非法劳教。

李新坤还参与了对其它在校炼功师生的迫害，包括：退休教师陈景孟（曾被非法拘留），青年教师王文华，学生孙静，吴晓天，吴晓梅，阎妍（后被送青浦洗脑班迫害）等。

李新坤还参与了对九九届毕业走上社会工作的交大校友的迫害，包括：蒋新霞（工业设计系），沈雁雁（工业设计系），叶剑飞（信控系），万锋（能源系）等。 他还参与了对中欧国际学院的张强（交大管理学院毕业）洗脑迫害；对交大校属公司的王旭东（交大化工学院硕士毕业，后被非法判刑四年半）的迫害；他还是白根娣（上海首例被劳教，家住交大附近在交大炼功）劳教迫害的主要推动者。

虽然已经退休好多年了，李新坤仍每天到交大保卫处，监视和左右最新的对交大大法弟子的迫害形势。