一九九九年七月，江泽民开始利用手中权力，颠倒黑白，疯狂地抹黑和迫害法轮功。七月二十日早晨，敖汉旗公安局局长张晓新把当时的几个辅导员包括吉晓东找到局里，说明邪党中央不让炼法轮功了，让他保证不上访。吉晓东当时没有配合，说明上访是宪法赋予每个公民的权利，公安局无权剥夺。

当天晚上，大约三十多名法轮功学员进京上访，第二天在天安门遭到警察拦截。七月二十五日，敖汉旗警察把吉晓东等人绑架回敖汉，宫传兴等人给吉晓东戴上手铐，非法关押在看守所。后来，转到拘留所，七月三十一日，被宫传兴勒索二百元后放回。

敖汉旗地税局针对吉晓东完全符合宪法的上访行为给予警告，自治区和赤峰市地税局开始受邪党指使，要求吉晓东写所谓的思想汇报，让他颠倒黑白，辱骂大法，和邪党中央保持一致。吉晓东一再澄清事实，说明真善忍是正确的，说明上访是正确的。

九九年十月一日，吉晓东再次上访，被北京警察绑架到西城区看守所。敖汉旗公安局警察宫传兴、肖玉光、地税局副局长孟凡江、司机李明军把他从北京绑架回敖汉，十月六日，赤峰市地税局局长王凤来在会议上违反宪法，将其非法强行开除，剥夺工作权利，并在全市下发文件。

二零零一年七月二十三日，吉晓东终于结束邪党迫害，获得自由。而此时，他的妻子已经再婚，敖汉旗地税局又因为他没有放弃修炼，没有“转化”，继续剥夺他的工作。他没有办法，只得住在同修家里，用手工刻写蜡纸做真相资料。一天晚上，他和同修喷写法轮大法好、真善忍好的标语，被恶人构陷，遭到恶警李凤军等人绑架。

在看守所里，他几次绝食，前后近三个月，抗议迫害。公安局局长张晓新全然不顾他无罪的事实，把他报检察院非法批捕，敖汉旗法院李润贤、王丽华助纣为虐，枉法裁决，使得他无辜受刑五年。

敖汉旗公安局局长张晓新、政委秦凤山相互勾结，把吉晓东非法劳教二年。吉晓东的妻子不明真相，和吉晓东强行办理了离婚手续，一个好端端的家庭被邪党拆散。