一九九九年七月二十四日始，张忠飞、童秀莲的工作单位－－中国农业工程研究院为逼迫他们放弃信仰，给他们办了半个月的所谓“学习班”进行洗脑。每日除领导“谈话”，就是强迫写所谓学习“心得体会”，放污蔑大法的录像。当时农业部由万宝瑞副部长任“六一零”主任，亲自抓法轮功学员的所谓“转化”工作，张忠飞、童秀莲因坚持信仰，被迫离开了工作了五年多的农业工程研究院。

张忠飞、童秀莲被非法关押于北京朝阳区看守所，十月十七日被转至丰台看守所，十二月三十日又被转至海淀看守所。二零零四年八月二十六日，北京海淀区法院未通知家属对张忠飞、童秀莲非法开庭。非法庭审时，审判长李莉多次打断张忠飞的辩护，后借休庭之时将张忠飞、童秀莲送回看守所。二零零四年九月八日海淀法院将非法判决他们各自八年徒刑的判决书送至看守所，张忠飞、童秀莲均拒签拒收，并上诉至北京市第一中级人民法院。

张忠飞出狱后，其户籍所在地张北县两面井乡党委书记臧建兵拒绝给张忠飞办身份证，并在所谓敏感日子派人到张忠飞亲戚家四处寻找张忠飞，妄图继续绑架迫害。期间还多次让派出所所长到内蒙联系，企图将张忠飞户口私自迁至内蒙，因当地不接收才作罢。