重庆地区也是迫害法轮功学员严重地区之一。重庆各地的公、 检、司、法都参与了迫害，即使在中共体制下的法律条款中也找不到任何法律依据的前提下，对法轮功学员非法判刑，其目的是逼迫法轮功学员放弃对真、善、忍的信仰。被非法关入监狱的法轮功学员，遭受各种精神摧残和酷刑迫害，多人在监狱被迫害致死。

曝光重庆市司法监狱系统参与迫害法轮功的部分官员：

现任重庆市司法局局长林育均

现重庆司法局副局长杨增渝，负责市监狱局工作

现重庆司法局党委委员，谢伦，负责市劳教局工作

原重庆女子监狱监狱长吴大茂

吴大茂：重庆女子监狱（2009年10月份以前）监狱长。热衷追随中共邪党。在其监狱大会上，总要攻击和贬低法轮功。2009年10月以后，据称，因与文强涉黑案有关，再未露面。