二零一一年十二月任湖南省委政法委书记。二零一二年五月至今,任湖南省委政法委书记、湖南省公安厅厅长、党委书记。孙建国对其任职期间湖南省所有被非法抓捕、关押、洗脑、劳教、判刑和被迫害致死、致伤、致残、精神失常以及失踪的法轮功学员负有直接领导责任。
中共十八大即将召开之际,二零一二年九月初,在湖南省“六一零”主任陈树林(兼省政法委副书记)、副主任蒋和平、政法委书记孙建国等人的策划下,长沙市捞刀河洗脑基地又开办洗脑班,具体由邵云辉、蒋志飞、杨路等人主管。
二零一二年九月份至十月二十二日,查实被劫持到该洗脑班的有:张灵革、田昌保、周冬英、蒋美兰、黄菊秀、周金莲、杨老师、一名不知姓名的十九岁的女大学生、吴国辉等。
十三年来,据不完全统计,湖南省已有一百七十四位法轮功学员被迫害致死。其中株洲四人、长沙二十九人、湘潭十五人、永州九人、怀化二十三人、益阳十二人、邵阳七人、娄底二人、常德二十四人、郴州十一人、衡阳二十一人、岳阳十七人。