二零零一年三月，陈卓颐再次上京，在广州东站被设在车站地下室的“六一零”非法抓捕，关进沙河收容所（那里已关押有十四个法轮功学员）。

关进后的第两天，因不配合恶警迫害，被女管教们反铐、踩在地上用两只电棍一齐电很长时间，整个脸都红肿起来。电完后，又用辣椒喷雾对着她的脸喷，差点令她窒息，但仍没法从她口中知道姓名地址。

在非法关押期间，不给她洗澡（甚至后来因灌食全身脏透也不让洗澡），每天只给一点喝的水，连大便也是用木筷子挑下去的，就这样关了差不多两个月。后因绝食，被野蛮灌食至口内出血。

绝食十四天后，“六一零”部门联合收容所、精神病院的陈德智医生和院长，将她连同十四个法轮功学员被强硬送到广州市白云区精神病院继续迫害，将她们关进精神病院最后一区平房（那里有五十多个全是没人要的精神病人，连给病人打针也叫吸毒的人来操作）。医生陈德智开始叫隔壁男仓三个吸毒的打手冲进来殴打陈卓颐，拳脚交加，一边打还一边说：“在精神病院里，打死人不用负责任的，还炼就打到你死为止。”她当时被打得全身多处呈紫色，肋骨剧痛，最后翻不了身，起床都需要人扶，后来因全身生满疥疮，已发烂，胀脓，才被放出去。十四个学员也相继通通被殴打，全身都多处受伤，还有一个被打得当场晕过去。