一九九九年十一期间，吉林市农科学院主管迫害法轮功的副书记杨士超因担心王忠富去北京上访，强行将他关押在单位里，不许他回家。白天和晚上由单位保卫处的人轮流看管，直到十月八日那天才允许他回家。

二零零一年六月底，在劳教所被迫害一年后又延期三个月后王忠富被释放。在回来之后的日子里，一再被农科院及开发区六一零追踪调查，所谓的思想情况及行动去处。王忠富本应当回来后就上班，但他为了今后不再给单位领导添麻烦，经过一番思考后，他向单位主管领导副书记杨士超写了一封辞职信。于是杨士超马上在报纸上登了告示：告诉王忠富在十五天之内回来上班，否则予以除名。这样十五天过后王忠富被非法辞退。