1999年9、10月，中共对法轮功的迫害不断升级。但张晓彤从来没有退缩过。期间她多次进京为法轮功上访，并被警察抓去关押、审讯。之后，她被海南警察抓回海口市继续迫害，被关在海口市第二看守所，并多次被抄家，拿走大法书籍和炼功音乐带。直到2000年初将她释放。

2000年3、4月间，因张晓彤拒绝在所谓的“转化书”上签名，又遭绑架。被关押在海口市白龙南附近的一个街道办事处。

因海口市所有非法关押法轮功学员的场所已经爆满，遂将她长期关押在某县看守所。她以绝食抗议邪恶的暴行。恶劣的生存环境和折磨，对她的肉体和精神造成极大伤害。她的身体出现了严重病症，生命垂危。邪恶的610不得不通知艺校接她回校。回校后，仍让她住在学生宿舍。学校派专人看守她，监视她的一举一动，不让法轮功学员跟她接触，限制她的人身自由。

2001年1月4日，恶警又将她抓去审讯。被关押三个月时，再度生命垂危。2001年4月4日才不得不将她释放。

2005年3月10日，张晓彤被迫害致死。