高秀芹于二零零二年十月被绑架到济南第一女子监狱第四监区，她的婆婆受到儿媳妇被绑架的打击，在焦虑中于十二月五日去世。

高秀芹在监狱里面被迫做生产服装、缝纫等劳动，第四监区区长许某某强迫她们在地下室干活，环境潮湿恶劣，高秀芹炼功前患有类风湿，通过炼功好了，进去后在迫害下又犯了。在里面，从早晨七点一直被迫干到第二天凌晨一、二点，最早干到晚上十二点，除了吃饭、上厕所以外一刻也不停。因为高秀芹身体情况，她干到晚上十点。住的监室里面，一个监室十二个人，只有一个大法学员，专门有两个连号看着，有事就牵连到她们，扣她们的分。

高秀芹被迫害的在二零零五年冬天半身疼痛，不能动。她于二零零六年二月被放出来时，身体非常虚弱，到医院检查已是乳腺癌晚期，于二零零七年四月一日下午四时含冤去世。