1999年7月19日,徐卫东得知外地的一些辅导员被抓,他和他的母亲夏桂芹还有许多功友于1999年7月20日登上去北京的列车要去北京上访,可是到沈阳就被警察劫下了车,于是他和功友于1999年12月份又去北京上访,被非法抓捕关到北京拘留所,元旦过后即半月后被放出。
2000年9月28日,徐卫东又与他母亲和功友到北京为法轮功申冤,在丰台区功友家被非法抓捕,后被非法劳教三年,被关押在吉林市欢喜岭劳教所四大队。为抗议非法关押和劳教所对法轮功学员的非人虐待,徐卫东数次绝食,被劳教所动以酷刑,并先后调于四大队、教育队、二大队加重迫害,身心和肉体遭受严重摧残。他在劳教所里受了很多苦,恶警们用几根电棍同时电他,逼他转化,他也没有屈服。一次给他野蛮灌食时,他被灌得昏死过去半个多小时,后送到吉林市越山路二二医院抢救又缓过来了,直到一年后把他折磨得奄奄一息,劳教所怕他死在劳教所里承担责任,才把他送回家。
由于徐卫东长期遭受酷刑折磨,他的身心承受巨大伤害,在从劳教所出来之后不久,他便一直不清醒、不说话,生活不能自理。后不幸于2004年12月29日含冤去世。