董慧在任职期间，对迫害当地法轮功学员负有不可推卸的责任。

二零一一年十一月二十三日，媒体曾大肆吹捧报道同江市公安局长董慧所谓锐意进取无私奉献，先后立所谓的二等功、三等功、佳木斯市优秀公仆、全国政法战线先进工作者等。真实的情况是，董慧积极执行江泽民流氓集团迫害法轮功的邪恶政策，对当地法轮功学员跟踪、盯梢、监控、绑架、抄家、非法关押洗脑班，把同江市打造成大监狱，自二零一零年四月起，被非法监禁、迫害的法轮功学员达近百人，酷刑折磨和洗脑迫害，拘禁期限少则数日，多则长达七个月。

董慧在任佳木斯市公安局治安支队队长时始终在迫害法轮功的一线，参与绑架、抄家。据不完全统计，仅在二零一三年里，佳木斯地区仍被非法关押在各地监狱迫害的法轮功学员达30人次（其中女性21人，男性9人）；遭各地劳教所迫害的法轮功学员达11人次（均为女性）；遭中共不法人员骚扰、绑架勒索的至少28人次（其中女性约18人，男性约10人，有3人仍被非法关押在各地看守所，面临非法判刑）；遭中共长年高压迫害，身体状况逐渐恶化后含冤离世的法轮功学员达18人（其中女性10人，男性8人）。二零一三年内遭骚扰、绑架的法轮功学员至少28人。