纪兴龙在担任期间，积极参与迫害法轮功，当地法轮功学员遭绑架、抄家、非法拘禁、关入洗脑班等迫害，纪兴龙都难辞其咎。部分案例如下：
1、二零零六年六月三十日上午九点左右，玉田县沃洛沽镇贾言庄子村法轮功学员郭秀英在丰台镇发救人的大法真相资料时，被宁河县丰台镇派出所警察绑架。当天下午五点钟左右，丰台镇派出所、沃洛沽镇派出所的警车嚎叫着闯进郭秀英家中，进行非法抄家。抄走了大法书籍和真相资料。郭秀英当天晚上九点，被非法关入宁河县看守所。几日后，又被非法带入玉田县。

2、二零零八年二月二日，玉田县法轮功学员薛广银、静恩玉被绑架。

二零零八年二月二日上午，河北省玉田县彩亭桥镇东五里屯村女法轮功学员薛广银（65岁）、静恩玉（64岁）在发真相资料时，被河北省玉田县公安局国保大队、彩亭桥镇派出所警察绑架，中午又非法抄家，抄走了大法书籍、真相资料及薛广银家现金二千元。两位老人被非法关押在玉田县拘留所。二零零八年二月四日上午，警察又逼迫两位老人的家属各交拘留所一千元饭费，其家人非常担心在新年之际两位老人遭警察的阴谋迫害。

3、二零零八年三月十一日，玉田县法轮功学员李志民被绑架。

在中共邪党的两会前夕，玉田县610拟对一百多名法轮功学员采用蹲坑、特务跟踪、秘密监控等流氓手段进行迫害。二零零八年三月十一日上午，玉田县玉田镇海子中心学校退休女教师李志民在贴真相传单时被玉田县公安局玉田镇派出所警察绑架，在没有任何法律依据、没有通知家属的情况下被非法关押在玉田县拘留所。

4、二零零九年五月十九日下午四点左右，窝洛沽镇政府与镇派出所八九个警察非法闯入窝洛沽镇东大街村法轮功学员王素丽家中，将九名法轮功学员一起绑架。

5、二零零九年十月七日十点钟，玉田县暖泉河法轮功学员李泽梅（小丽）在家中被玉田县城关派出所警察绑架、抄家，电脑，打印机，大法书籍等都被抢走。

6、二零一零年一月九日晚，玉田县林西派出所（林西镇境内）绑架了法轮功学员徐翠云和邵淑敏，关入铁笼子折磨，警察向她们脸面、鼻孔喷洒腐蚀性很强的粉末（警察自己的皮肤都不敢碰着）。第二天，这两位女学员被劫持到玉田县非法拘留；同时两人被非法抄家，家中的私人财产被抢，她们的丈夫也被绑架到林西派出所。十一日下午，警察勒索每家一万元后，才把徐翠云的丈夫和邵淑敏的丈夫释放回家。

7、 二零一零年六月二十三日，玉田县公安局国保大队五、六个警察非法闯入玉田县散水头镇十里砣村法轮功学员孙玉山家。进屋不问青红皂白，到处乱翻，电脑、很多大法书籍被掠走，并说这是上级的命令。孙玉山被绑架到哪里家人不知道。亲属去公安局打听才知孙玉山被关押到了洗脑班，但洗脑班在哪里，公安人员不告诉。

纪兴龙在二零一三年五月至二零一六年十二月担任唐山丰润区区委书记期间，在唐山丰润区发生的迫害法轮功事件中，他也是难逃其责，负有主要领导责任。