黄卫国自二零零二年就参与了对亳州市谯城区法轮功学员的迫害，当时黄伟国刚刚被提拔为亳州市公安局谯城区分局的副局长。二零零二年七月前后，谯城区和市国保警察联合办案分别非法抓捕了十八名法轮功学员。

当时市公安局成立了专案组。市公安局马副局长担任组长，其中就有黄卫国。当时市公安局把十八名法轮功学员分别关押在五个县市的看守所，其中还有一个关在外省。

市区公安局把绑架十八名法轮功学员包装成一个大案要案，省公安厅专人坐镇监督。黄卫国在专案组担任什么职位具体不详，就知道他很凶，狠恶。这些法轮功学员不同程度的都受到了酷刑折磨，还有的智伤致残。

二零零二年七月二日上午九时左右，安徽省亳州市谯城区公安分局黄卫国、王久山一行四人，突然闯入贾彦华办公室强行把她带到龙华宾馆，逼迫她承认讲真相的行为是所谓违法的，更利用恶毒的手段对贾彦华全家进行了六天五夜的迫害。贾彦华被非法判刑5年。

二零零二年七月七日下午，他们把她送到河南省鹿邑县看守所羁押。因未经河南省公安厅批准和没有亳州公安局异地羁押证明，当时鹿邑县看守所拒收。黄卫国、吴宪彬找鹿邑县公安局分管局长和政保股通融，在答应第二天补办手续的情况下，鹿邑县看守所才同意暂时羁押。

二零零四年十月十一日晚，亳州市谯城区公安局吴先彬等在局长黄卫国的坐镇指挥下，对吴云瑞等五名学法轮功的经商者进行了非法抓捕。吴云瑞、张婉荣、贾素玲、谢景真、贾永平被带到谯城区刑警大队（城里派出所院内），蔡灵芝被带到谯城派出所。黄卫国调动了三县一区的女警轮流看守。

经过一天一夜的非法审讯后，黄卫国等人把吴云瑞、张婉荣、贾素玲、谢景真四人送到亳州市看守所进行非法关押，蔡灵芝被送到涡阳看守所，贾永平被送到蒙城县看守所进行非法关押。合肥四位女士在薛阁派出所被非法审讯和拷打后被送往利辛看守所进行非法关押。

二零一零年六月十九日，六十一岁的大法弟子吴碧琳第十二遭中共绑架，被非法关押到了武汉市江岸区谌家矶洗脑班。黄卫国到洗脑班来企图“转化”吴碧琳，胡绍斌还威胁吴碧琳说不“转化”就要判刑。