黄保卫在军队干了二十三年，他做到了济南军区空军航空兵训练基地主任，这是一个副师级职位。一九九九年底，他转业担任郑州市公安局副局长。之后他调任三门峡市公安局局长，开始主政一市警界，他还曾担任三门峡市副市长，兼任市公安局局长、党委书记。

他在三门峡市任公安局长期间，为了要一架直升飞机，把三门峡范围内矿山的矿长绑票，然后，让家人拿钱把人赎回。

二零零七年六月起，黄保卫返回郑州，任郑州市政府副市长、党组成员，市公安局局长、党委书记，市委政法委副书记。二零一一年九月，任郑州市委常委、政法委书记，市公安局局长、党委书记。二零一二年七月，任郑州市委常委、政法委书记，市公安局局长、党委书记、督察长。二零一五年一月任郑州市委常委（正市厅级）、政法委书记。二零一八年至今，任郑州市政协主席、党组书记。

黄保卫担任郑州市公安局局长近八年，担任郑州市政法委书记达七年，将郑州市的政法大权集于一身。他在追随江泽民流氓集团迫害法轮功时，不予余力地推动迫害政策、下达迫害指标，操纵郑州市、区、县、乡警力对法轮功学员采用电话监听、网络监控、大肆绑架、抄家、关押、诬判、迫害致死、致残。

到郑州市开始上任于二零零七年八月十六日对郑州市大法弟子进行疯狂抓捕，造成近百十名大法弟子被绑架、非法拘留、劳教、关押等。

二零零七年八月十六日中午一点多，警察闖入民宅綁架许秀珍，未出示任何证件非法抄家，掠奪许秀珍絲人財物，包括：所有的大法书，两个mp3，两个充电器，一个电子书，一个DVD机器，还有一个台式计算机。

许秀珍家屬为了營救许秀珍，花了不少钱打通关系，许秀珍女婿通过熟人找到郑州市公安局局长黄保卫，二七国保大队副队长李森，还有郑州市公安局一个李姓警察，把许秀珍从郑州第二看守所，让许秀珍戴着脚镣（脚都磨破了）提审到二七公安局，让许秀珍和家人见面。

当时非法提审许秀珍的警察告诉许秀珍家人叫许秀珍在一份印好的「保证书」材料上签字，保证回家不炼法轮功，说是只要能签字就放许秀珍回家，许秀珍坚决不同意签字，所以又被非法劳教一年。

郑州动物园派出所在二零一零年五月非法抓捕三名法轮功学员，据了解，指使抓捕法轮功学员的是郑州市公安局，由局长黄保卫下令， 抓一个法轮功学员，派出所给一千到一千五百元钱，送往监狱或劳教所后，派出所可以得到相应的分数，来抵派出所的任务；如果派出所完不成任务，所长就被撤职或调离。

二零一三年十月，河南省郑州市政法委、610授意金水区政法委、610、区教体局、区委、四家联合签发了“致学生家长的公开信”，发给该区一百零九所中小学、九十二所幼儿园的十二万零九百一十四名在校学生和家长，落款后注明要求签名上交。公开信内容诬蔑大法，毒害学生与家长。

二零一六年，郑州市政法委把控告江泽民的法轮大法学员劫持到洗脑班，二至四个人为一期。每个大法学员由一、二个社区人员日夜陪护，形影不离。不准大法学员串门，不准互相说话，不准回家。这个地方是郑州政法委临时租的，每天几千元的费用。青龙山庄洗脑班的幕后主谋是郑州市委政法委书记黄保卫。

二零一六年五月三十日，巩义市法院对法轮功学员白春花非法开庭，法轮功学员王文昌、高凤舞、张远恒、崔金霞、付淑凤、崔素萍、绍伟芳、赵松茂、兰巧珍等参加庭审。非法庭审后，庭外的法轮功学员去法轮功学员贺传龙家，结果被政法委、610操纵巩义市各片派出所同时出动了几十个警察，把在贺传龙家的二十几名法轮功学员绑架到中心派出所。

据明慧资料统计，仅仅在二零一六年一月至十月河南省郑州市政法委、610操控、胁迫公检法等人员参与迫害法轮功，导致至少有法轮功学员杨中省被迫害致死，有十七人被非法判刑或长期非法关押，有二十多人遭绑架。

黄保卫任职期间，对法轮功学员杨中省、杨中耿、李西录、杨树才、袁宏伟、卢运来、潘立峰等的被迫害致死，以及对诬判的张建来、牛羽格、王金普、邢爱香、陈真萍等数十名法轮功学员负有不可推卸责任。