刘军在任瓦房店市公安局政经保大队队长与副局长期间曾积极参与迫害法轮功学员。

二零零七年七月九日，参与绑架高卓、崔德君等八名大法弟子，导致高卓、崔德君等被送辽宁马三家教养院非法劳教。此人长期从事对大法弟子的犯罪活动。

二零零九年四月九日上午九点左右，瓦房店市“610“伙同西杨乡派出所恶警绑架了西杨乡许家小学教师倪翠霞，并非法抄家。倪翠霞的女儿（未婚小女孩）曾多次去瓦房店市公安局找政经文保大队队长刘军（迫害倪翠霞的主要指使人），要求见其母一面，但刘军拒绝见面。

倪翠霞的女儿经多方打听到刘军住处，在四月十五日晚上九点左右由朋友陪同欲到刘军家问明情况，按门铃时，刘军的妻子说：“找错了。”此时从四面窜出近二十个左右便衣，手持警棍（四根）、棒子和大长刀（刀长一米左右），对大法弟子的女儿及朋友一顿暴打，然后把他们拖到楼后的山上继续殴打，嘴里还说：“你不就是法轮功吗？你找刘军干什么？”还用刀架在其朋友的脖子上进行恐吓威胁说：“今天就把你俩埋在这山上。

二零零九年年四月二十四日，在大队长刘军指使下，公安局政经文保大队恶警伙同站前派出所警察对洪振雁进行了非法抄家。洪振雁被绑架后，他的家属多次到得利寺派出所要求放人并要求归还私家车，然而此事的直接责任人、得利寺派出所副所长黄孝群却说此事与他无关，称他是受命于瓦房店市公安局政经文保大队长刘军。

二零一一年五月十一日下午三点左右，在辽宁瓦房店市复州城镇邪党人员王勇策划下，瓦房店市公安局副局长刘军亲自指挥绑架复州城镇大窑村七旬法轮功女学员张万华，并非法抄家。张万华被劫持到复州城公安派出所，并被非法审讯。恶人企图对张万华非法劳教，由于张万华出现严重病态，被劳教所拒收，恶徒才于当晚释放她。