在任职沈阳市市长期间祸害百姓、伤天害理。自一九九九年七月江泽民开始迫害修炼“真、善、忍”的法轮功以来，辽宁省是中共迫害法轮功学员最严重的省份之一，据明慧网《中共酷刑虐杀法轮功学员调查报告》统计，从一九九九年七月中共迫害法轮功至二零一三年十二月，辽宁省有423名法轮功学员被迫害致死。陈政高负有不可推卸的罪责。

在访问台湾期间，陈政高因迫害法轮功遭到起诉。回沈阳后不思悔改，反而变本加厉迫害法轮功学员。

辽宁警察将大法弟子于溟从抚顺罗台山庄洗脑班转押到马三家二大队，图谋进一步迫害。恶党恶警认为于溟参与大连大法弟子崔德军从马三家走脱事件，二零零八年八月十三日绑架了于溟的妻子，并把于溟从马三家转押到抚顺罗台山庄洗脑班迫害，十一后又把他转押回马三家二大队，并不许任何人探视。

此事惊动邪党“中央”，令安全部、北京公安局国保支队、辽宁省公安厅联合迫害于溟，酷刑逼迫于溟承认参与营救。二零零八年九月二日是于溟两年半的非法劳教到期，马三家拟给于溟非法延期两个月，“上面”指示说“处理太轻”。目前，恶党人员正对于溟实施更大的迫害。

据消息，陈政高亲自在“处理”于溟的决定上签字，现在至少有七名警察因此“事故”被扒了警服，马三家有两个副所长被“处理”。此事恶党极力掩盖，甚至连马三家的其它警察都不知道这些警察被处理的真正原因。

辽宁省省长陈政高写信叫教养院加重迫害于溟。

大法弟子于溟曾三次被邪党非法劳教，共被非法关押逾八年。于溟原两年半的非法劳教期于二零零八年九月二日到期，但邪党恶警对他非法延期一年，并将他从马三家教养医院转到马三家教养院一所三大队（迫害法轮功大队，二零零八年九月二十九日成立）。辽宁省“六一零”给教养院下达百分之百“转化”大法弟子的邪恶命令，三大队二中队恶警头目王彦民多次叫嚣：有两个死亡名额，谁要给谁一个。恶警把教养院编造的自杀声明拿给于溟，强迫他签字，然后想预谋虐杀他，用伪造的自杀声明书来掩盖他们的罪恶。于溟不配合，不签字，恶警就强迫他按手印，并对他进行毒打、电击、吊铐数天。

二零一三年四月八日，辽宁省长陈政高曾以视察调研为名到丹东，亲自到各市、县、区，检查迫害法轮功的情况。在其操控下，被丹东恶党绑架、判刑的法轮功学员，已知姓名的（不完全统计）有十五人，还有两名东港市法轮功学员的常人亲属被抓、被判。他们是：东港市法轮功学员孙桂清、郭运兰、孙桂玲、滕秀玲、郑桂香、于天仿；凤城市法轮功学员张紫阳、刘成军、范晓胜；丹东市五龙背镇法轮功学员周林；丹东元宝区法轮功学员李丽华；丹东振兴区法轮功学员周庆云、秦丹平；沈阳法轮功学员韩春龙、陈新野。还有东港市法轮功学员的常人亲戚孙小四、孙小五。于天仿和张紫阳被非法拘留半个月放回家，郑桂香被抓后不知下落，其余的人五人被判刑，其他人被非法关押。
其中沈阳法轮功学员韩春龙，在身体极其虚弱、生命危急的情况下，于七月十日被丹东恶警强行送进沈阳市康家山监狱迫害，韩春龙至今绝食反迫害，生命危在旦夕。

二零零七年五月二十一日，于溟被转关到以酷刑恐怖出名的辽宁省马三家教养院，又遭到以于江、李猛为首的狱警毒打、电击、吊铐数天，并将他关在特制的大铁笼子里三个月，不能站、不能躺。因为拒不“转化”出了名，二零零八年奥运时候，中共辽宁省“六一零”头子陈政高直接下达命令指挥迫害他，以实现马三家劳教所所谓“百分之百“转化率”。这次，狱警们用电棍电击他的生殖器；往身上泼凉水之后，用绳子将他固定在一个位置，然后硌他的下体，又用铁棍击打他的头部，使他昏死。

二零零八年奥运时候，中共辽宁省「六一零」头子陈政高直接下达命令指挥迫害他，以实现马三家劳教所所谓「百分之百「转化率」。这次，狱警们用电棍电击他的生殖器；往身上泼凉水之后，用绳子将他固定在一个位置，然后硌他的下体，又用铁棍击打他的头部，使他昏死。那一次，狱警以为于溟必死无疑，叫来犯人洗净他浑身上下的血，换上一身衣服，让狱医给他缝上脑袋上被铁棍打出的血口子，然后将他抬到一个封闭隔离的房间里，恶警们甚至伪造好了于溟的撞头自杀声明书，作为掩盖他们虐杀罪行的证据。但是于溟又一次活了过来，恶警的阴谋才没有得逞。