李崇禧曾是周永康大秘，在周任职四川省委书记期间一路高升。一九九九年周永康从国土资源转任中共四川省委书记，二零零零年八月，李崇禧调任四川省委秘书长、办公厅主任，成为周永康的大秘，同年十二月，李崇禧仕途进一步攀升，进入四川省委常委，成为四川省委核心成员。二零零二年李崇禧担任四川省纪委书记。二零一三年一月开始，李崇禧担任四川省十一届政协主席。多次召开旨在对法轮功学员进行迫害的全省公安局长秘密会议。

一九九九年十一月六日，阿坝州数名法轮功学员到北京上访被遣返后，其中一名学员到阿坝州金川与当地同修交流回到工作地点后被非法抓捕。据当时马尔康县检察长李金贵披露：当检察院认为证据不足而向李崇禧汇报时，李崇禧明确指示：没有证据找证据，一定要审判。

随后，阿坝州两名法轮功学员分别被马尔康县法院和汶川县法院以“组织并利用邪教组织罪”（中共是真正的邪教）判处有罪免予刑事处罚。

一时间阿坝州笼罩在红色恐怖中之中。李崇禧下令：每个单位有法轮功上访的，领导一律免职。全州抽出所有公检法干部对付法轮功，凡处置法轮功的任何费用均有州财政实报实销，对镇压有功者，措施得力者给予重奖，并列入主要考核指标。并将公安在此之前打入法轮功后获取的名单下发给各地各级政府。对已掌握的法轮功人员实行变相监视居住。对被拘留者实行强制转化，对其亲属朋友以降职，扣发奖金，行政记过警告等处分施压。

二零零零年十二月二十一日的阿坝州“法轮大法好”标语案——明慧网曾以“法轮大法好”的红色通道为题报道过出现在国道213县都江堰至汶川一线九十余公里的公路沿线出现的四百多幅喷涂的“法轮大法好”标语——黄兴初在常委会上下死命令“破案”，并必须严惩重判。最后在二零零一年七月，法轮功学员冷涛被判刑十年。冷涛出狱后四处打工挣钱甚至没有低保。

李崇禧还曾签字把祝艺芳作为四川省重点迫害对象。

现年四十七岁的曾任四川省广元市政府驻成都办事处干部祝艺芳女士，因修炼法轮功多次遭到中共绑架迫害。曾被吊铐七天七夜，并被剥夺睡眠。四川省委副书记李崇禧签字把她作为四川省重点迫害对象。省“610”直接插手下达指示，广元市“610”和成都市“610”联合执行对她迫害，在广元看守所她被呈五马分尸状铐在铁床的四个角上。在2006年10月8日，祝艺芳被广元市旺苍县法院开庭审判，非法判刑7年，劫持到成都女子监狱。

出狱后，祝艺芳在亲人的精心照顾下，通过学法炼功，才从死亡线上挣扎回来，但身体药毒后遗症严重。广元市中共“六一零”恶人命令成都女子监狱再把祝女士绑架回来，要她死也死在监狱里。祝艺芳知情后离家流亡，终致二零一二年三月六日含冤离世。