一九九九年七月中共开始迫害法轮功后，身为区政法委副书记的肖作义紧跟恶党执行对法轮功学员“名誉上搞臭、经济上截断、肉体上消灭”的灭绝政策，指挥东西湖“六一零”（专门迫害法轮功的非法机构，凌驾于法律之上）勾结公检法司等政府部门迫害法轮功学员。

在二零零零年至二零零四年，东西湖“610”有计划地举办了十几期洗脑班，至少有八十多名法轮功学员被关进洗脑班，三十多人被非法劳教，几百人被监视居住。

东西湖“六一零”与公安、司法、派出所、居委会相互勾结迫害法轮功学员的手段有：跟踪、监视居住、监听电话、无故骚扰、非法限制人身自由、非法抓捕、绑架、关押、勒索钱财，非法抄家、搜身、抢劫财产、威逼口供、谩骂、殴打、电击、关水牢、关禁闭体罚（剥夺睡眠，长时间站）、精神洗脑、劳教、劳改、株连等，致使无数家庭生活在血泪之中。

据“追查迫害法轮功国际组织”二零零四年八月十日公告，肖作义是首批被“追查国际”发出追查通告的中共官员之一。