从一九九九年七月二十日以后，孙玉龙积极跟随江氏流氓集团参与迫害修心向善的法轮功学员，曾经配合当地派出所、矿区公安处等，去本单位法轮功学员家非法抄家、恐吓、诱骗写“保证”、“悔过书”之类的东西。

在一九九九年迫害初期，孙玉龙还曾把本单位几名法轮功学员非法软禁在保卫科，晚上也不准回家，逼迫这些法轮功学员放弃修炼，他们签了“保证书”之后，才被放回家。
孙玉龙还曾参与非法拘留、劳教、判刑法轮功学员等。那些年，在邪党的“敏感日”，孙玉龙就去本单位法轮功学员家骚扰，逼迫放弃修炼。

后来，孙玉龙被免去保卫科科长职务，调到劳保科，仍不知悔改。妻子与他离婚，儿子也不怎么和他来往。

下面是孙玉龙直接参与迫害法轮功学员的部份事实。

◇迫害法轮功学员张德辉等

一九九九年“七•二零”江氏集团开始打压法轮功，一九九九年九月份，东风矿保卫科科长孙玉龙，逼迫本单位法轮功学员写“保证书”，人人过关，法轮功学员不配合，他又怕他们进京上访，孙玉龙就把法轮功学员张德辉、姜波涛、王树海等非法拘禁在保卫科，派人看着，不许回家，大约四、五天。

二零零三年三月，七台河市多名法轮功学员被绑架，由东风矿保卫科科长孙玉龙和戍企派出所一个不知姓名警察，到法轮功学员张德辉家，以让他去了解情况为由，企图绑架他，张德辉拒不配合，后来他们打电话，找来戍企分局政保科和110警察，强行把法轮功学员张德辉绑架到戍企分局，张德辉不想受他们的迫害，想走脱没成功，被戍企分局警察毒打一顿，被非法关押在七台河行政拘留所。

◇迫害法轮功学员李新春

二零零零年四月，法轮功学员李新春去了北京为法轮功上访，在北京地下通道被警察绑架，警察把他送到七台河驻京办。当时是七台河“610”头子毕树庆和其他三人在场，把李新春铐在床上。李新春开始绝食，他们怕出事，就给他的单位打电话。二零零零年五月十三日，李新春被东风矿保卫科王爱民带回当地。二零零零年五月十五日，李新春被保卫科孙玉龙、韩永江劫持到市行政拘留所，在那里，李新春被非法关押了十五天。

二零零零年五月十六日，李新春被东风矿保卫科勒索600元。二零零零年六月，李新春被东风矿保卫科勒索200元（主要责任人：孙玉龙）。