罗志军任职南京市期间，该地区法轮功学员遭大量绑架和非法判刑，至少十三位法轮功学员被迫害致死。

南京市「六一零」设立洗脑班黑据点，二零零三年租用栖霞区新联机械厂招待所──伯乐宾馆，据悉，年租金达四十余万元；南京市委书记罗志军曾专门到此黑窝参观，并给「六一零」发三十万元经费用以迫害，还邪恶地放言只要上明慧严正声明，一律非法劳教三年。

二零一六年六月底，罗志军被免去江苏省委书记，提前「被退休」。