一九九九年任焦作市市委副书记、市长；二零零一年二月至二零零四年一月任市委书记期间，有三位女性法轮功学员被迫害致死：白爱香四十二岁、刘改五十五岁、张春琴五十岁。

秦玉海因迫害法轮功得到中共的重用；二零零四年一月他被提拔至河南省政法委副书记、省公安厅厅长；二零一三年一月任河南省人大常委会副主任、党组书记。秦玉海专门负责迫害法轮功。

据明慧网信息统计，秦玉海任职期间河南省至少有六十四名法轮功学员被迫害致死，他们生前有的遭受残酷的酷刑折磨、刑讯逼供、抄家、罚款、开除公职、非法拘留迫害、劳教、判刑等，被迫害的家破人亡。秦玉海是河南省迫害法轮功的主要责任人。

秦玉海早年在石油系统，由于与周永康的交集，又被当时任河南省委书记的李长春选中为其看家护院，所以能在省公安厅厅长、省政法委副书记这个位置上一干就是九年。

从高官周永康、秦玉海再到地方小吏郭法杰，他们都是推动江泽民犯罪集团对法轮功“群体灭绝”、“酷刑”犯罪链条的重要环节。