在一九九九年中共迫害法輪功時，林文輝被內定為所謂的福建省六大重點人物之一，迫害一開始就被非法關押，很長的時間是關在山裡，一個與世隔絕的環境，有人看著，就是不准與外界接觸，一直到二零零八年他才恢復自由。

林文輝隨後去北京做點小生意，可是，臨近奧運會時，福建公安到北京，以所謂的奧運安保為名要帶林文輝回福建，林文輝不願回去，他們就把林文輝關進了北京豐台看守所，非法勞教兩年，由北京轉到了內蒙古興安盟圖牧吉勞教所。

二零零九年二月二十六日在圖牧吉勞教所，法輪功學員們抵制奴役，下午二隊中干事陳強（警號：1519074）把法輪功學員宋志宇叫到辦公室，一進門就破口大罵，把真相信摔到宋志宇臉上，並跳起來打了宋志宇兩個耳光，說宋志宇是領頭的，還揚言隨時用暴力迫害。二隊中隊長（封閉隊）黃自剛，又當胸打了宋志宇好幾拳，並揚言如果還不加班，就再打。二十七日上午，還在車間編地毯的宋志宇被黃自剛隊長帶到陳強的辦公室，又是恐嚇又是毆打，後來見宋志宇不屈服，陳就把宋志宇背銬在四樓大廳東北角的暖氣管子上。中午也沒有讓宋回到樓下吃飯。

二十七日下午，法輪功學員林文輝、王占青、李建青、吳南傑等九名法輪功學員得知宋志宇遭折磨的消息，要求見宋志宇。當時在辦公室的隊長有畢國榮、黃自剛、吳隊長等沒有合理的答復，法輪功學員們就拒絕下午的出工。那幾個惡警（隊長）拿出電棍、膠皮棒等警具，開始毆打法輪功學員，後來王利偉教導員也參與其中，法輪功學員被打得退到大廳裡。

惡警們（隊長）還邊追邊打，像瘋了一樣，沒頭沒臉的打，用電棍電。打完之後，把林文輝、王占青、李建青、吳南傑、馬友、鄭軍六名法輪功學員關進了一樓的小號裡，兩個人一個小號，共三個小號。惡警陳強進到小號後，強迫法輪功學員脫掉衣服，只穿內褲。二月份的圖牧吉外面還是冰天雪地，小號裡兩名法輪功學員被一個手銬連著，雖然後來開放了地暖氣，但時冷時熱，地上沒有舖的，身上沒有蓋的。隨後幾天，法輪功學員王占青、李建青、吳南傑被惡警陳強、姓楊的隊長殘忍迫害，吊在門框上的鐵條上。被關在小號裡的法輪功學員也不讓躺著，只要隊長一上班，就讓法輪功學員面壁站著，如有不從者或走動者，惡警畢國榮（隊長）就拿著電棍電。

在內蒙古遭受兩年迫害後，林文輝回到福建老家，回家一個月左右，林文輝乘火車去外地，在火車上，他身上的法輪大法書籍被乘警發現，被非法抓捕。

林文輝再次被非法勞教。在勞教所期間被檢查出肝腹水，勞教所怕承擔責任，辦保外就醫由當地政府接回家，林文輝去醫院檢查診斷為肝癌晚期，於二零一二年三月十日去世。

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更新日期: 2023年3月4日 18:57